/etc が謎の肥大化。原因はetckeeper （.git/）。

# du -hsc /etc*

15G total

# du -hs /etc/*

（略）

81M total

なぜだ・・・
と思ったら隠しディレクトリに原因が。

# du  -hsc /etc/.*

15G     /etc/.

du: cannot access `/etc/../proc/14172/task/14172/fd/4': No such file or directory

du: cannot access `/etc/../proc/14172/task/14172/fdinfo/4': No such file or directory

du: cannot access `/etc/../proc/14172/fd/4': No such file or directory

du: cannot access `/etc/../proc/14172/fdinfo/4': No such file or directory

16G     /etc/..

8.0K    /etc/.etckeeper

15G     /etc/.git

4.0K    /etc/.gitignore

0       /etc/.pwd.lock

45G     total

なんで/etcに.gitがあんねん！ひょっとして間違ってうっかり git init でもやっちゃったのかなぁ心当たりないなぁ。
と思って軽く調べてみたらetcのバージョン管理を自動でやってくれるetckeeperという仕組みが勝手にデイリーでコミットし続けてくれている事が発覚。

etckeeper 肥大化 とか etc 肥大化 とかで検索しても大した情報は見つからなかったのですが、
とりあえず

# cd /etc

# git gc

Counting objects: 28413, done.

Compressing objects: 100% (26954/26954), done.

Writing objects: 100% (28413/28413), done.

Total 28413 (delta 21602), reused 0 (delta 0)

Removing duplicate objects: 100% (256/256), done.

# du -hsc /etc/.git

45M /etc/.git

45M total

スッキリしたみたいです。